آتشسوزی دوم در مسجدالنبی، در زمان قایتبای مملوکی روی داد.
رمضان سال 886ه.ق، آتشسوزی وسیعی در مسجدالنبی رخ داد. در این وقت، قایتبای مملوکی، اختیار حرمین را در دست داشت.